Capítulo II
De la Encomienda a la Hacienda, 1535-1646
En 1535, Francisco Pizarro nombró a Pedro Martín, Encomendero de Cayambe. El Encomendero era un señor feudal encargado de cristianizar a los indígenas y cobrarles tributo.
El cobro de tributos para el Encomendero era efectuado por los Caciques (Jefes Indígenas). En Cayambe, el Cacique era don Gerónimo Puento nieto de Nasacota Puento, el guerrero que resistió a los Incas por más de 10 años.
En Guachalá, Joan Mitma, hijo de don Diego Pallo, Cacique de Cuzco era Cacique de los mitimaes de Guachalá.
En 1548, la Encomienda pasa al hijo de Pedro Martín, Alonso Martín de Quezada, nombrado por La Gasca. A Joan Mitma le sucede Francisco Cacuango Guachalá, sujeto a don Fabián Puento, hijo de Gerónimo Puento. Nótese que los mitimaes de Guachalá pasan a depender ahora de los Cayambis.
Alonso Martín de Quezada muere antes de 1573 y hereda su esposa la Encomienda, quien luego posiblemente se casó con Martín de Aizaga, pues aparece este en 1573 como Encomendero de Cayambe con 2.100 súbditos y 500 pesos de renta.
En 1585, la Encomienda de Cayambe pasa a la Corona de España y el Cabildo de Quito entrega a Martín de Aizaga una merced (donación) de 100 caballerizas (1.100 há) en Guachalá. También recibe Mateo de Aguirre 100 caballerizas en Guachalá. En esta época se construyó la primera iglesia.
Hombre muy importante de la época fue don Alonso de Carvajal, nacido en Sevilla en 1563. Siendo niño pasó a las Colonias en 1570 (7). Fue comisionado de visita de las Cajas Reales de Paita, Piura y Guayaquil, levantando gran fortuna. Vino a Quito en 1592 como Auditor de Guerra del Gnrl. Pedro de Arana, cuando el asunto de las alcabalas; luego fue Auditor General de la Armada del Sur, Abogado de las Reales Audiencias de Panamá, Lima y Quito, Corregidor de Otavalo 1600-1603 (3), introductor de ganado en la ciudad de Quito, mercader de paños y poseedor de un comercio en Lima.
Alonso de Carvajal acuerda con los indígenas de Guachalá el pastoreo de sus ovejas en las tierras de éstos a cambio de dinero. Compra la merced de tierra de Mateo de Aguirre que pertenecía, entonces, a un señor Cevallos y suponemos que de igual forma hizo con la merced de tierra de Martín de Aizaga, pues a su muerte en 1645 aparece con 214 caballerizas de tierra en Guachalá (2350 há). Le hereda su nieto Francisco de Villacís . | 
